Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb4A2A863 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms