Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hdac6Q9Z2V5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Hdac6Q9Z2V5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Hdac6Q9Z2V5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hdac6Q9Z2V5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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