Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Mbd3Q9Z2D8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mbd3Q9Z2D8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms