Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cldn9Q9Z0S7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn9Q9Z0S7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cldn9Q9Z0S7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms