Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clip2Q9Z0H8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clip2Q9Z0H8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms