Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pfdn5Q9WU28 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pfdn5Q9WU28 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pfdn5Q9WU28 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pfdn5Q9WU28 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pfdn5Q9WU28 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pfdn5Q9WU28 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Pfdn5Q9WU28 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pfdn5Q9WU28 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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