Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cry2Q9R194 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cry2Q9R194 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms