Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Col5a3Q9JLI2 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Col5a3Q9JLI2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Col5a3Q9JLI2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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