Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ush1cQ9ES64 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ush1cQ9ES64 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms