Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Usp29Q9ES63 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms