Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ube3bQ9ES34 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ube3bQ9ES34 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms