Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pop5Q9DB28 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms