Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39lQ9DB16 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39lQ9DB16 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39lQ9DB16 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39lQ9DB16 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39lQ9DB16 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cab39lQ9DB16 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cab39lQ9DB16 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms