Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cnn3Q9DAW9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms