Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc89Q9DA73 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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