Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms