Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Derl3Q9D8K3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms