Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Alkbh4Q9D8F1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms