Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn22Q9D7U6 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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