Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm5Q9D7I9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms