Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ttc9bQ9D6E4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms