Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lonrf3Q9D4H7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms