Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Syce1Q9D495 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Syce1Q9D495 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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