Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Snx29Q9D3S3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Snx29Q9D3S3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Snx29Q9D3S3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Snx29Q9D3S3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Snx29Q9D3S3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Snx29Q9D3S3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Snx29Q9D3S3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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