Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rufy3Q9D394 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms