Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syf2Q9D198 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Syf2Q9D198 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms