Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Susd3Q9D176 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Susd3Q9D176 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms