Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Sgo1Q9CXH7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sgo1Q9CXH7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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