Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Xrcc3Q9CXE6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Xrcc3Q9CXE6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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