Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Btk-202ENSMUST00000113213 2121 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Sec61bQ9CQS8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Sec61bQ9CQS8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm15398-202ENSMUST00000219998 1477 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Sec61bQ9CQS8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Sec61bQ9CQS8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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