Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Smim8Q9CQQ0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms