Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Higd2aQ9CQJ1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms