Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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