Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudt21Q9CQF3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms