Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl11Q9CQF0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms