Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nsmce3Q9CPR8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms