Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt23Q99PS0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt23Q99PS0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms