Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprtQ99M80 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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PtprtQ99M80 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprtQ99M80 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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