Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RtcbQ99LF4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RtcbQ99LF4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms