Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vmp1Q99KU0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Vmp1Q99KU0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms