Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nlgn1Q99K10 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms