Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacsin3Q99JB8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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