Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
CsprsQ99388 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CsprsQ99388 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms