Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf144aQ925F3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rnf144aQ925F3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnf144aQ925F3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnf144aQ925F3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rnf144aQ925F3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rnf144aQ925F3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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