Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
SptssbQ925E8 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
SptssbQ925E8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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