Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Csmd1Q923L3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms