Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Klc3Q91W40 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms