Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Sh3bgrl3Q91VW3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms