Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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