Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc12Q8R344 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc12Q8R344 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms